Nuo 1994 metų Lietuvos politologų asociacija kartu su VU Tarptautinių santykių ir politikos mokslų institutu kasmet organizuoja metines politologų konferencijas:
- Politinių idėjų revizija Lietuvoje, Europoje ir pasaulyje: politinės tikrovės ir jos analizės tendencijos (2010 m.)
- Kad demokratija veiktų žinių visuomenėje (2009 m.)
- Lietuva po Seimo rinkimų 2008 m. (2008 m.)
- ES vaidmuo valstybių narių politinio ir kultūrinio tapatumo kaitoje (2007 m.)
- Demokratijos kokybė Rytų ir Vidurio Europos šalyse (2006 m.)
- Rytų Europos politinės raidos tendencijos (2005 m.)
- Lietuva po Seimo rinkimų 2004 (2004 m.)
- Vidurio Europa po Europos Sąjungos ir NATO plėtros (2003 m.)
Konferencija buvo organizuojama kartu su CEPSA (CEPSA annual conference 2003 Central Europe Beyond Double Enlargement) - Lietuva po Prahos (2002 m.)
- Lietuvos politinė kultūra: stereotipai ir raidos tendencijos (2001 m.)
- Lietuva po seimo rinkimų 2000 (2000 m.)
- Politikos mokslai Lietuvoje: retrospektyva ir perspektyvos (1999 m.)
Konferencija skirta politikos mokslų Lietuvoje 10-čiui ir Vilniaus universiteto 420-čiui paminėti - Viešasis administravimas Lietuvoje: profesionalumo ir efektyvumo paieškos (1998 m.)
Remiant "Algirdo Brazausko fondui" ir Eurofakulteto tarptautinei programai - Interesų grupės, valdžia ir politika (1997 m.)
Remiant K. Adenauerio fondui - Lietuva ir jos kaimynai (1996 m.)
Remiant K. Adenauerio fondui - Demokratija Lietuvoje: elitas ir masės (1995 m.)
Remiant bankui Snoras - Lietuvos nacionaliniai interesai ir jos politinė sistema (1995 m.)
Kartu K. Adenauerio fondu
Lietuvos politologų asociacija organizuoja ir tarptautinius seminarus bei konferencijas:
1998 m. II-oji Baltijos ir Šiaurės šalių konferencija Regionalizmas ir konfliktų sprendimas (kartu su VU TSPMI ir Uppsalos universitetu).
1996 m. Politinio režimo trasformacija: naujoji politika Vidurio ir Rytų Europoje (kartu su Tarptautine politikos mokslo asociacija, dalyvaujant jos prezidentui J. Leca bei generaliniam sekretoriui J. Coakley).