Nuo 1994 metų Lietuvos politologų asociacija kartu su VU Tarptautinių santykių ir politikos mokslų institutu kasmet organizuoja metines politologų konferencijas:

• Demokratijos kokybė Rytų ir Vidurio Europos šalyse (2006 m.)    
• Rytų Europos politinės raidos tendencijos (2005 m.)     
• Lietuva po Seimo rinkimų 2004 (2004 m.)    
• Vidurio Europa po Europos Sąjungos ir NATO plėtros (2003 m.)
      Konferencija buvo organizuojama kartu su CEPSA (CEPSA annual conference 2003 Central Europe Beyond Double Enlargement)
• Lietuva po Prahos (2002 m.)
• Lietuvos politinė kultūra: stereotipai ir raidos tendencijos (2001 m.)
• Lietuva po seimo rinkimų 2000 (2000 m.)
• Politikos mokslai Lietuvoje: retrospektyva ir perspektyvos (1999 m.)
       Konferencija skirta politikos mokslų Lietuvoje 10-čiui ir Vilniaus universiteto 420-čiui paminėti
• Viešasis administravimas Lietuvoje: profesionalumo ir efektyvumo paieškos (1998 m.)
      Remiant "Algirdo Brazausko fondui" ir Eurofakulteto tarptautinei programai   
• Interesų grupės, valdžia ir politika (1997 m.)
      Remiant K. Adenauerio fondui
• Lietuva ir jos kaimynai (1996 m.)
      Remiant K. Adenauerio fondui
• Demokratija Lietuvoje: elitas ir masės (1995 m.) 
      Remiant bankui Snoras 
• Lietuvos nacionaliniai interesai ir jos politinė sistema (1995 m.)
      Kartu K. Adenauerio fondu

Lietuvos politologų asociacija organizuoja ir tarptautinius seminarus bei konferencijas:

      1998 m. II-oji Baltijos ir Šiaurės šalių konferencija Regionalizmas ir konfliktų sprendimas (kartu su VU TSPMI ir Uppsalos universitetu).

      1996 m. Politinio režimo trasformacija: naujoji politika Vidurio ir Rytų Europoje (kartu su Tarptautine politikos mokslo asociacija, dalyvaujant jos prezidentui J. Leca bei generaliniam sekretoriui J. Coakley).